Home

Кластерный анализ популяций Salmonella Enteritidis, выделенных в различных регионах Сибири и Дальнего Востока

Автор: Раков А.В., Кузнецова Н.А., Соловьева А.С., Яковлев А.А.

  Индекс УДК: 579.842.14:57.063.8:519.237.8(571.1/.5+571.6) | Страницы: 23–26 | Полный текст статьи. PDF файл | Скачать PDF 

Аннотация:

Проведен кластерный анализ основных плазмидных типов Salmonella Enteritidis, циркулирующих на территории Сиби ри и Дальнего Востока, на основе плазмидных свойств исследуемых штаммов. Выявлены кластеры микроба, соответст вующие плазмидным типам. Не обнаружено различий в штаммах, выделенных в западных и восточных регионах РФ, по спектру обнаруженных в них плазмид и отношению к антибиотикам. Показано значение исследования устойчивости к налидиксовой кислоте и канамицину как значимых эпидемиологических фенотипических маркеров для S. Enteritidis. Подтверждена эффективность применения плазмидного анализа как метода определения популяций возбудителя. При кластерном анализе данных, полученных с помощью других методов, например, пульс-электрофореза, мультило кусного сиквенс-типирования, количественного определения чувствительности к антибиотикам и других, будут полу чены более точные выводы о структуре популяции S. Enteritidis и ее изменчивости.

Ссылки на авторов:

А.В. Раков1, Н.А. Кузнецова1, А.С. Соловьева1, А.А. Яковлев1, 2
1 НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова (690087, г. Владивосток, ул. Сельская, 1),
2 Тихоокеанский государственный медицинский университет (690002, г. Владивосток, пр-т Острякова, 2)

Раков Алексей Владимирович – канд. мед. наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и экологии патогенных бактерий НИИЭМ; e-mail: Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.


1. Елиусизова А.Б., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Бахолдина С.И. Чувствительность к фторхинолонам сальмонелл в Си бири и на Дальнем Востоке // Тихоокеанский мед. журн. 2010. № 4. С. 51–54.
2. Раков А.В. Молекулярная эпидемиология сальмонеллеза в Сибири и на Дальнем Востоке // Acta Biomedica Scientifica. 2007. Т. 53, № 1. С. 236–237. 
3. Раков А.В., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А. Гетерогенность плазмид молекулярной массой 1,4 МДа в штаммах Salmonella Enteritidis // Бюллетень СО РАМН. 2013. Т. 33, № 2. С. 10–15. 
4. Раков А.В., Шубин Ф.Н. Сравнительный геномный анализ плазмиды вирулентности Salmonella enterica подвид enterica серотип Enteritidis // Генетика. 2019 (в печати). 
5. Семина Н.А, Сидоренко С.В., Резван С.П. [и др.]. Опреде ление чувствительности микроорганизмов к антибакте риальным препаратам // Клин. микробиол. и антимикроб. химиотер. 2004. Т. 6. № 4. С. 306–359. 
6. Чекунина С.Н. Эпидемиологическая оценка факторов, детер минирующих эпидемический процесс гепатита А и шигел лезов (на модели Приморского края): автореф. дис. ... канд. мед. наук. Омск, 2017. 20 с. 
7. Шубин Ф.Н., Ковальчук Н.И., Кузнецова Н.А. [и др.]. Ми кробиологический мониторинг за Salmonella Enteritidis в Приморском крае. Фенотипическая и плазмидная харак теристика возбудителя // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2002. № 2. С. 36–40. 
8. Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А. Гетерогенность популяции Salmonella Enteritidis на предприятиях промыш ленного птицеводства и ее отражение в эпизоотическом процессе // Вестник Новосибирского государственного аграрного университета. 2013. Т. 27, № 2. С. 118–121. 
9. CDC. An Atlas of Salmonella in the United States, 1968–2011. 248 p. URL: https://www.cdc.gov/salmonella/pdf/salmonellaatlas- 508c.pdf (дата обращения 25.09.2018).
10. Earl D.A., von Holdt B.M. Structure Harvester: a website and program for visualizing Structure output and implementing the Evanno method // Conservation Genetics Resources. 2012. Vol. 4, No. 2. P. 359–361.
11. Graziani C., Losasso C., Luzzi I. [et al.]. Salmonella // Foodborne diseases: Third edition. Chapter 5. 2017. Cambridge: Academic Press. P. 133-169.
12. Havelaar A.H., Kirk M.D., Torgerson P.R. [et al.]. World Health Organization Global Estimates and Regional Comparisons of the Burden of Foodborne Disease in 2010 // PLOS Medicine. 2015. Vol. 12, No. 12. P. e1001923.
13. Paudyal N., Pan H., Li X. [et al.]. Antibiotic resistance in Salmonella Enteritidis isolates recovered from chicken, chicken breast, and humans through National Antimicrobial Resistance Monitoring System between 1996 and 2014 // Foodborne Pathogens and Disease. 2018. Published online 3 October. URL: https://doi.org/10.1089/fpd.2017.2402 (дата обращения25.09.2018).

ИЗДАТЕЛЬСТВО: Медицина ДВ

Год основания: 1997  |  Выпусков в год: 4, Статей в выпуске: 30  |  ISSN печатной версии: 1609-1175  |  Подписной  индекс: 18410 (Агентство “Роспечать”)  |  Тираж: 1000 экз.

 

Close Panel